AQUACULTURE BIOINFORMATIC

Pengembangan EST berasal RSK dan SNP sebagai suatu genom
sumber daya lele di India, Clarias batrachus

Ikan lele penting bagi perikanan dan industri akuakultur. Clarias batrachus, sebuah spesies lele endemic dari India ,cukup umum distribusi di air tawar dari dataran seluruh India. C. batrachus dibudaya dalam ruang yang terbatas membuatnya menjadi pilihan dan spesies potensial. Namun produksi perikanan budidaya dibatasi oleh tingkat pertumbuhan yang lambat dan kerentanan terhadap penyakit. Intervensi untuk genetik perbaikan dalam multigenic komersial penting seperti sifat tergantung pada ketersediaan penanda genetika molekuler dan penggunaan penanda tersebut dalam program pemuliaan yang efisien.  C. batrachus dapat berguna dalam pemetaan keterkaitan, perbandingan genomik studi dan untuk perbaikan genetik program. 

Untuk menghasilkan EST dan tipe I, informasi untuk C. batrachus, kita sequencing 1.937 klon dari jaringan limpa ikan lele dewasa. Limpa ikan sebanding dengan yang mamalia dan terdiri dari jaringan limfoid terbesar di teleost yang melindungi ikan terhadap darah patogen. Ini rumah sel-sel kekebalan seperti T, dan B sel, yang mampu menghancurkan atau menetralisir antigen dalam untuk mencegah manifestasi lebih lanjut dari penyakit. Oleh karena itu, sejumlah besar gen kekebalan transkrip relevan, terlibat dalam ketahanan terhadap penyakit, akan diharapkan di perpustakaan limpa. Dengan demikian, tujuan dari ini bekerja adalah untuk mengkarakterisasi tipe I penanda dari diekspresikan urutan tag dari limpa spesies lele India, untuk asosiasi dan studi pemetaan hubungan untuk program perbaikan genetiknya.

JURNAL DAPAT DILIHAT DI SINI